腹泻除影响婴幼儿对食物中营养物质的吸收外，还消耗体内储存的营养物质，损害某些机体组织。这是因为在腹泻过程中，本来应该消化吸收的营养物质不能进入机体，但机体内各器官还需照常进行各项生理功能。如长期慢性腹泻就会造成营养不良，使患儿身体瘦弱，抵抗力降低，容易感染各种疾病。这不仅影响婴幼儿的正常生长发育，还会引起并发症。
常见的并发症有：
营养不良及维生素缺乏症
腹泻病程较长，如禁食时间过久或长期热量不足，常可引起营养不良和各种维生素缺乏症。消化不良与营养不良可互为因果，往往造成恶性循环，导致不良后果。维生素ａ缺乏可引起干眼症及角膜软化症；维生素ｄ缺乏可引起手足抽搐症。
感染
常见有中耳炎、口角炎、上呼吸道感染、支气管炎、肺炎、疖肿、败血症、泌尿道感染及静脉炎等。各种感染可能成为腹泻的病因，但也有在腹泻之后，由于全身抵抗力降低而继发感染。迁延性腹泻或原有营养不良病儿，容易并发真菌感染，如鹅口疮、真菌性肠炎，甚至引起全身性真菌病。
中毒性肝炎
重型腹泻可能出现黄疸，常见于营养不良及重症败血症病儿，预后不良，故中毒性肝炎是腹泻的严重并发症之一。
其他
如急性肾功能衰竭、弥漫性血管内凝血、感染性休克、中毒性脑病等，如处理不当还可发生急性心力衰竭、高血钾、中毒性肠麻痹、肠出血、肠套叠等，偶可见肠穿孔和腹膜炎。
婴幼儿腹泻的预后与病儿的体质、病因、治疗时机和治疗方法有关。
（1）体质因素
体质衰弱（重症营养不良和佝偻病）的病儿，由于机体代谢调节功能较差，抵抗力低下，容易发生各种并发症，使腹泻迁延不愈，预后较差。新生儿、早产儿病情易于迅速恶化，预后也较差。
（2）病因
耐药性致病性大肠杆菌或其他耐药细菌感染预后较差，继发二重感染者如真菌、金黄色葡萄球菌感染等预后也差。
（3）治疗时机
轻型腹泻若未及时治疗，导致病情严重，迁延日久，预后较差。
（4）治疗不当
未进行调整和适当限制饮食，减少胃肠道负担；未及时控制肠道内外感染以及纠正水与电解质紊乱和加强护理，导致各种并发症发生，影响预后。此外，滥用广谱抗生素，引起菌群失调和二重感染，可加重消化功能紊乱，如不及时停药，迁延不愈者预后差。
何恩泽儿科提醒：对于婴幼儿腹泻，如果没有及时治疗，会对宝宝的身体造成很大伤害，所以父母们应该要及时发现宝宝腹泻的各种症状并及时治疗。最近秋季腹泻开始达到顶峰，如果您的宝宝出现大便不正常的现象请您用塑料袋装取大便带来化验检验，确诊是普通肠炎还是病毒性肠炎，由于二者治疗方式不同，父母们切不可在未知发病原因的情况下乱用药，导致宝宝病情加重。
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